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공부

[왓슨 분자생물학] 16장 유전암호
공부/분자생물학 2023. 12. 23. [왓슨 분자생물학] 16장 유전암호 16.0 유전암호 - 64개 조합의 아미노산을 갖는다. 아미노산은 20개. 코돈 중복 발생. 16.1 암호의 퇴화 - 64개 조합 중 61개는 아미노산을 지정. 3개 코돈은 사슬 종결코돈 - 퇴화성 : 많은 아미노산들이 1개 이상의 코돈으로 지정되는 현상 - 동의어 : 같은 아미노산을 지정하는 코돈들 - 처음 2개 nt 가 동일하고 3번 째 nt 가 시토신이나 우라실이면 같은 아미노산을 암호화 한다. (ex. UUU와 UUC는 페닐알라닌을 지정하는 동의어) - 모든 퇴화성이 처음 두 nt 가 같은 때에만 나타나는 것은 아니다. - 류신은 CUU, CUC, CUA, CUG, UUA, UUG 에 의해 암호화 된다. - 3번째 자리의 동등성에 의한 코돈 퇴화성은 아미노산 수준의 상대적 비율에 변화를 주지 않고..
분자생물학 암기노트 - 1
공부/분자생물학 2023. 12. 19. 분자생물학 암기노트 - 1 1. 항생물질 작용 기작 원핵 진핵 전사 억제 (RNA pol 에 작용) Rifampicin, Actinomycin D, Acridine α-Amanitin, Actinomycin D, Acridine 번역 억제 (리보솜에 작용) Kanamycin(50S,30S), Chloramphenicol(50S), Erythromycin(50S), Tetracycline(30S), Streptomycin(30S), Furomycin(50S), Hygromyicin B (30S), Diptheria(EF-Tu/EF-Tu) Cyclohexamide (60S) 2. DNA 구조 - 가장 일반적인 B형 구조 : 10bp - 응축된 A형 구조 : 11bp - 매우 응축된 Z형 구조 : 12bp 3. Primase : RNA..
[왓슨 분자생물학] 15장 RNA 이어맞추기 (Splicing)
공부/분자생물학 2023. 12. 13. [왓슨 분자생물학] 15장 RNA 이어맞추기 (Splicing) 15.0 RNA 이어맞추기 - 한 유전자의 인트론 개수는 매우 다양. 효모유전자는 대개 1개. 사람의 경우 30개도 있다. - 인트론은 RNA 이어맞추기 과정으로 mRNA 전구체에서 제거된다. - 이 splicing 과정에서 mRNA 전구체는 성숙 mRNA로 전환하고, 엑손이 연결되는 부위에서 1개 nt 라도 첨가나 결실이 되지 않아야 한다. (첫 코돈에 의해 정해지는 고정된 읽기틀에 따라 번역되기 때문) - 몇몇 mRNA 전구체는 대체이어맞추기를 통해 대체mRNA를 만든다. (대체이어맞추기 방법이 여러개) - 이런 대체 산물은 이성질체라고 한다. 90% 이상이 대체이어맞추기에 의해 1개 이상의 이성질체를 만든다. 15.1 RNA Splicing 의 특성 1. RNA 내부서열의 중요성 (어디를 자를 것이..
[왓슨 분자생물학] 14장 발현-4
공부/분자생물학 2023. 12. 8. [왓슨 분자생물학] 14장 발현-4 14.9 번역의 조절 - 번역단계에서의 조절은 외부자극에 대해 빠르게 반응할 수 있음 - 번역수준에서의 조절은 mRNA 전사수준 이후에서 필요한 시간 절약 가능 - 진핵생물에서 mRNA 가공과정, 합서 이후에 세포질 이동에 필요한 시간을 절약 - 단백질 수준의 조절 : 번역 개시단계의 조절 (초기단계가 중요) 1. 세균의 번역 조절 - 조절자의 1차표적 : 30S 소단위에 의해 RBS가 인식되는 것을 억제 (저해제들이 RBS 주변서열과 결합하여 공간적 방해) 16S rRNA와 mRNA의 결합 방해 - RNA 분자의 고리화 : mRNA가 스스로 염기쌍을 형성하여 RBS를 숨긴다 → ORF 번역을 막는다. - 다른 ORF를 가진 경우, mRNA 염기쌍 형성이 깨져 다른 유전자가 번역된다. → RBS 숨김현상..
[왓슨 분자생물학] 14장 발현-2
공부/분자생물학 2023. 12. 5. [왓슨 분자생물학] 14장 발현-2 14.2 mRNA - mRNA 번역기구 : mRNA, tRNA, 아미노아실 tRNA 합성효소, 리보솜 - tRNA : 아미노산과 mRNA 코돈 사이에서 경계면을 제공 - 아미노아실 tRNA 합성효소 : 아미노산과 tRNA를 연결시킨다. tRNA 3'말단에 아미노산 부착(고에너지 필요) - 리보솜 : tRNA에 의해 mRNA가 정확히 결합될 수 있게 조정. A자리, P자리, E자리 존재. 펩티드 사슬 결합을 촉매 1. 폴리펩티드는 ORF 에 의해 지정 - ORF(open reading frame) : mRNA 의 단백질 암호화부위, 하나의 단백질을 지정. 개시코돈~종결코돈까지의 서열. 진핵은 mRNA에 1개 ORF를 가지지만, 원핵은 2개 이상의 ORF를 가져서 다수의 폴리펩티드 사슬번역이 가능. - 폴리..
[왓슨 분자생물학] 14장 발현-1
공부/분자생물학 2023. 12. 2. [왓슨 분자생물학] 14장 발현-1 14.0 발현 1. mRNA 서열은 3개 뉴클레오티드가 한 세트로 해독된다. - 코돈은 64개 조합이 가능하다 2. tRNA 는 mRNA 코돈과 아미노산을 맺어준다. - tRNA는 안티코돈을 가진다. - 핵산과 아미노산 사이를 연결해주는 효소는 아미노아실-tRNA (ATP 소모) - 코돈에 따라 특정 아미노산을 각각의 tRNA 에 결합한다 - mRNA 결합한한 리보솜은 (작은 소단위) 개시코돈을 인식하면 tRNA-Met와 결합 (곧 제거됨) - 어댑터 분자 : tRNA. 아미노산과 코돈을 인식한다. 3. 특정효소가 tRNA에 상응하는 아미노산과 연결시킨다 (아미노아실-tRNA) - RNA３‘말단에 아미노산을 부착시킴 - 아미노아실 tRNA 합성효소는 기질특이성이 강하다 - 리보솜의 E자리, P자리, A자..
[왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -3
공부/분자생물학 2023. 12. 2. [왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -3 13.3 진핵생물의 전사 (암기필요) - 진핵생물은 RNA pol I, II, III 존재. 많은 전사인자 (GTF, 보편전사인자)가 필요 - DNA 포장이 잘 되어있어 풀기 어렵고, 매개복합체ㆍ결합조절단백질ㆍ염색질 변형효소가 필요하다. - TPB : TATA Binding protein. 보편전사인자 불러모음 - TAF : TATA associated factor. TBP 연결인자 1. RNA pol II의 핵심 프로모터 - 약 40~60nt 로 구성. 핵심요소 존재 (BRE, TATA, Inr, DCE(하류), DPE(하류), MTE) - BRE : TFIIB 인지요소 - 핵심 프로모터 외에도 조절서열을 가짐 → 조절서열은 프로모터 근접요소, 상류활성서열, 증폭자, 사일렌서, 경계요소, 절연인자 같은..
[왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -2
공부/분자생물학 2023. 12. 2. [왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -2 13.1 RNA pol 과 전사 주기 - RNA pol은 프라이머 필요 없음. 합성된 RNA는 효소에 의해 방출된다. 방출과 전사가 동시진행 - 프로모터에서 전사시작 (5‘→3’ 방향) 하나의 유전자에서 많은 전사체 합성 가능 (조절기능) - 같은 세포나 다른세포에서도 다른 유전자 전사를 함 1. RNA pol 공통적 특징 - RNA pol II는 모든 단백질 유전자의 전사를 담당 - RNA pol I은 큰 전구체 유전자를 전사. RNA pol III는 tRNA, 작은 핵 RNA, 5S rRNA 유전자 전사 - RNA pol IV, V 발견 : 전사침묵 관여하는 iRNA를 전사 (간섭 RNA) - 진핵과 원핵의 RNA pol 효소 구조와 형태와 구성은 유사함. 주변부는 완전 다름 (다른 단백질과 상호작용..
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