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분자생물학

[왓슨 분자생물학] 18장 원핵생물의 전사조절-3
공부/분자생물학 2024. 1. 3. [왓슨 분자생물학] 18장 원핵생물의 전사조절-3 18.3 박테리오파지 λ 의 예 - 박테리오파지는 세균에서 용균,용원 중 1가지 방식으로 증식 - 용균성 성장 : 파지 DNA 의 복제와 새 외피 단백질의 합성이 필요. 이 성분이 결합하여 새파지를 만들고 숙주세포의 용해에 의해 방출 - 용원성 성장 : 파지 DNA가 세균에 삽입되어 복제 - 용원균은 휴면중인 프로파지가 DNA 를 손상시키는 인자에 노출되어 숙주세포 존재가 위협받으면 용균성으로 전환 - 용원성 유도 : 용원성 성장 → 용균성 성장으로의 유도 1. 선택적 유전자 발현 양상 - 박테리오파지 λ는 외피단백질, DNA 복제, 재조합, 용해 관련된 단백질을 암호화 - PL, PR : 항상 발현되는 프로모터. RNA pol 과 결합하여 활성인자 도움 없이도 전사 가능 - PRM : CI 유전자만 전..
[왓슨 분자생물학] 14장 발현-3
카테고리 없음 2023. 12. 6. [왓슨 분자생물학] 14장 발현-3 14.7 번역의 신장 - 사슬연장이 일어나기 위해 코돈에 맞는 아미노아실-tRNA 가 A자리에 와야 함 (신장인자 필요) → A자리의 아미노아실-tRNA와 P자리의 개시 tRNA와 펩티딜 전이반응으로 아미노산의 펩티드 결합 → 전좌 (소단위체 이동) 1. 신장인자 EF-Tu 역할 - 아미노아실-tRNA를 A자리로 전달. EF-Tu가 직접 리보솜으로 수송. (수줍음 많은 tRNA) - tRNA에 아미노산 결합하면 tRNA 3'말단에 EF-Tu가 결합해서 아미노산이 펩티드에 결합하지 못하게 보호 - 인자결합부위와 결합 → EF-TuㆍGTP를 가수분해 → 리보솜으로부터 방출 → tRNA가 펩티딜전이효소 중심으로 회전 (적응) → 다시 tRNA를 데려옴 - EF-Tu는 IF2와 마찬가지로 GTP와 결합. 가수분..
[왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -1
공부/분자생물학 2023. 12. 2. [왓슨 분자생물학] 13장 전사기작 -1 13.0 전사기작 - 단백질 분자의 기능은 20개 아미노산 서열에 의해 결정 - RNA splicing : RNA 전사체가 잘린 후 이어맞추는 과정 - 하나의 유전자에서 여러개 RNA 복사체가 만들어질 수 있다. 하나만 만들 수도 있다. (조절) 1. DNA 염기서열의 일부분만 RNA로 전사 - RNA는 단일가닥 사슬. 다양한 형태로 접힐 수 있다. 접힘구조 조절과 촉매기능도 수행 2. 전사는 DNA 가닥에 상보적 RNA를 만든다. - RNA pol은 새 리보뉴클레오티드를 RNA 사슬에 공유결합으로 연결 - RNA 가닥은 RNA 사슬이 방출되고 DNA 사슬이 다시 형성된다. - DNA 한 가닥만 전사되기 때문에 RNA는 단일가닥. DNA 이중가닥을 풀어야 함 - RNA pol은 뉴클레오티드를 연결하여 R..
[왓슨 분자생물학] 12장 자리특이적 재조합과 전위-1
공부/분자생물학 2023. 12. 2. [왓슨 분자생물학] 12장 자리특이적 재조합과 전위-1 12.0 자리특이적 재조합과 전위 (유전자 섞어주는 것. DNA 재배열) - 보존성 자리특이적 재조합(CSSR, Conservative site-specific Recombination) : 2개의 지정된 염기서열 사이에서 일어나는 재조합 (부서이동). 세린과 티로신 재조합 - 전위 재조합(Transposition recombination) : 특이적 서열을 비특이적으로 연결. 도약 (이직) - 재조합 효소가 특정 서열 인식하여 재조합이 DNA내에서 일어나게 한다. - 시냅스 복합체로 알려진 단백질-DNA 복합체를 형성하여 매개체와 촉매 역할을 한다. 12.1 보존성 자리특이적 재조합(CSSR) 1. 자리특이적 재조합과 특이적 염기서열 - CSSR은 DNA의 지정된 조각이 재배열되는 반응에 관련 → DN..
[왓슨 분자생물학] 11장 분자수준에서의 상동재조합-2
공부/분자생물학 2023. 11. 29. [왓슨 분자생물학] 11장 분자수준에서의 상동재조합-2 11.1 상동재조합 중요포인트 1. 가닥의 침투 - DSB가 존재해야 침투발생 시작 (3‘ 말단) - 가닥침투는 상보적 염기쌍을 안정적으로 형성하는 것 → 두 모체 DNA 사이에서 유전적 교환 - 가닥침투 촉매효소 : 가닥교환 단백질 - 이질 이중가닥을 형성하여 염기서열 차이를 지니면 염기서열 불일치 2. 홀리데이 연결부 분리 - 유전적 교환을 종결시키는 주요 단계. 2가지 방법 ① 이어맞추기(Splicing) : 교차산물들의 양 옆 부위 유전자를 재배열 ② 덧붙이기 산물 : 비교차 산물. 재배열 없음 3. 이중가닥 절단수선모델 - 3‘말단 꼬리를 만들어 침투하게 한다. (가공과정) 프라이머 역할 → 절단부위에 분해된 DNA 수선 - 여기에도 홀리데이 분리과정에 따라 교차가 생기는 지, 덧붙이기가 생기는..
[왓슨 분자생물학] 11장 분자수준에서의 상동재조합-1
공부/분자생물학 2023. 11. 29. [왓슨 분자생물학] 11장 분자수준에서의 상동재조합-1 11.0 분자 수준에서의 상동재조합 - 유전적 교환에 의해 염색체 재배열 → 교차 - 재조합은 염색체 사이의 DNA 염기서열의 물리적 교환을 수반함 - 전위인자(Transposon) : 큰 절편으로 이동하여 DNA 재배열 촉진. 유전자 변이, DNA 수선, 유전자발현 조절 역할을 함. 유전자 제거, 유전자의 역할을 밝히는 데에 기여 * 유전자 재조합 종류 - 상동재조합 (HR) : 1차 감수분열 전기의 교차 - 비상동말단 결합 (NHEJ) - 위치-특이적 재조합 - 전위 (트랜스포존) 1. DNA 절단이 재조합의 시작 (DSB, Double strand Break) - DSB 수선하는 주요 기작은 HR(재조합수선). 더 단순한 기작은 NHEJ(장애관통) - 원핵에서 DNA DSB는 수선 외에도 유전적 교..
[왓슨 분자생물학] 10장 돌연변이 발생과 DNA 수선 -3
공부/분자생물학 2023. 11. 29. [왓슨 분자생물학] 10장 돌연변이 발생과 DNA 수선 -3 10.4 재조합 수선과 장애관통 1. 재조합 수선 (HR) - 손상되지 않은 DNA (자매염색체)에서 서열정보를 복구 → DNA 절단을 수선 - 이중가닥 절단 수선 경로로 자매염색분체에서 복구 - 수선단계 : ①광회복 → ② 뉴클레오티드 절제수선 → ③ 재조합 수선 → ④ 장애수선 복제효소 - DSB : Double Strand Break. 이중나선 손상 (가장 유해한 손상). 복제불능, 염색체 소실. DSB 수선하는 여러 중첩 경로를 가진다. ① DSB 수선 경로 : 자매염색체 DNA 서열에 의존하여 수선 (정확, 매우 효과적) ② 비상동말단 수선 경로 (NHEJ) : DNA 말단을 연결해서 수선 1bp 길이의 염기 짝짓기에 의해 발생. 단일가닥 꼬리는 Nuclease 에 의해 제거. DNA pol 에..
[왓슨 분자생물학] 9장 DNA 복제-5
공부/분자생물학 2023. 10. 29. [왓슨 분자생물학] 9장 DNA 복제-5 9.10 결합과 풀림 - 개시인자 기능 ① 복제자의 특정 서열에 결합 ② 복제개시에 필요한 인자들과 상호작용하여 복제자 서열로 모이게 한다. ③ 이중나선이 열리도록 결합자리 부위 부근에 DNA를 뒤틀거나 푼다. - E. coli 개시인자 : 복제조절. DnaA. ATP 사용 - 진핵 개시인자 : 복제개시점 인식복합체. (ORC. Origin Recognition Complex) 6개 단백질 복합체. ATP 사용. 효모의 경우, A요소와 B1요소 (둘 다 보존적 서열) 인식. - ORC와 Dna A가 ATP 를 필요로 하는 이유 : 서열특이적 결합. Helicase를 DNA에 장전. Dna A 개시인자 Dna B Helicase Dna C Helicase 장전자 1. 개시과정 지시 - E. coli : D..
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